医EP50 从光遗传学(optogenetics)聊起@胡文韬

EP50 从光遗传学(optogenetics)聊起@胡文韬

在小宇宙播放
创作者写的节目说明

本期节目,和来自美国波士顿的胡文韬博士漫谈,从今年诺贝尔生理学或医学奖的获奖领域 optogenetics(光遗传学)聊起,深入了解一下文韬在美国罗切斯特大学的 PhD 研究工作;各自分享一个自己印象比较深刻的诺奖;而后探讨神经科学对于人工智能及大语言模型发展的指导和提示意义;最终聊一聊从学界转向工业界的心路历程和北美求职的一些经验~

时间线

光遗传学简介与文韬的 PhD 工作内容

脑部超声和光遗传研究工作的临床转化展望

各自分享印象比较深刻的一个诺奖

生物的神经网络对 AI 神经网络的启发

从学界到工业界的心路历程及北美求职经验

参考文献

## 参考文献与延伸阅读

### 文韬的博士研究

1. Hu W, Zhu S, Briggs F, Doyley MM. (2023). Functional ultrasound imaging reveals 3D structure of orientation domains in ferret primary visual cortex. NeuroImage, 268, 119889. [论文链接](https://doi.org/10.1016/j.neuroimage.2023.119889)|[开放全文](https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9999292/)

文韬第一作者的正式期刊论文:利用功能超声成像研究雪貂初级视觉皮层方向选择性功能区的三维结构。该文不报告光遗传学实验。

2. Hu W. (2024). Functional ultrasound imaging of the ferret early visual system. 博士学位论文,University of Rochester,Department of Electrical and Computer Engineering. [论文及全文下载](https://hdl.handle.net/1802/38273)

包括视觉功能组织、视网膜拓扑,以及结合光遗传学研究皮层膝状体反馈的工作。

3. Hu W, Zhu S, Briggs F, Doyley M. (2023). Functional Ultrasound Imaging Reveals Optogenetic Activation of Neuronal Clusters in Ferret Primary Visual Cortex. 2023 IEEE International Ultrasonics Symposium (IUS),会议海报报告,编号 B2P-15-MIM-1. [官方会议日程](https://confcats-siteplex.s3.us-east-1.amazonaws.com/ius23/IUS_2023_Program_V2_9095ef329c.pdf)

功能超声检测光遗传刺激相关神经元群活动的会议报告;此处按会议日程记录引用,不作为已确认的期刊论文。

### 光遗传学的关键发现与细胞靶向方法

4. Nagel G, et al. (2002). Channelrhodopsin-1: A light-gated proton channel in green algae. Science, 296(5577), 2395–2398. [论文链接](https://doi.org/10.1126/science.1072068)

鉴定绿藻通道视紫红质 ChR1,揭示其光门控质子通道功能。

5. Nagel G, et al. (2003). Channelrhodopsin-2, a directly light-gated cation-selective membrane channel. Proceedings of the National Academy of Sciences, 100(24), 13940–13945. [论文链接](https://doi.org/10.1073/pnas.1936192100)|[开放全文](https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC283525/)

阐明 ChR2 的直接光门控阳离子通道功能,为后续神经活动调控提供分子基础。

6. Boyden ES, Zhang F, Bamberg E, Nagel G, Deisseroth K. (2005). Millisecond-timescale, genetically targeted optical control of neural activity. Nature Neuroscience, 8, 1263–1268. [论文链接](https://doi.org/10.1038/nn1525)

在培养的哺乳动物神经元中,利用 ChR2 实现毫秒尺度的光学活动控制;张锋是该文第二作者。

7. Zhang F, et al. (2007). Multimodal fast optical interrogation of neural circuitry. Nature, 446, 633–639. [论文链接](https://doi.org/10.1038/nature05744)

结合光激活与光抑制工具,实现神经活动的双向调控;张锋为第一作者。

### 诺奖背景资料

- Karolinska Institutet. (2026). The Nobel Prize to the pioneers of optogenetics Peter Hegemann, Georg Nagel and Karl Deisseroth. [获奖介绍与研究背景](https://news.ki.se/the-nobel-prize-to-the-pioneers-of-optogenetics-peter-hegemann-georg-nagel-and-karl-deisseroth) 光遗传

- NobelPrize.org. (1981). The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1981. [官方获奖介绍](https://www.nobelprize.org/prizes/medicine/1981/summary/)

本期文韬提及的诺奖背景:David H. Hubel 与 Torsten N. Wiesel 因关于视觉系统信息加工的发现共同获得一半奖金;Roger W. Sperry 因关于大脑半球功能特化的发现获得另一半奖金。Hubel 与 Wiesel 对视觉皮层神经元特征选择性及功能组织的研究,与本期讨论的方向选择性和视觉皮层组织直接相关。[Hubel 诺奖演讲](https://www.nobelprize.org/uploads/2018/06/hubel-lecture.pdf)|[Wiesel 诺奖演讲](https://www.nobelprize.org/uploads/2018/06/wiesel-lecture.pdf)

- The Royal Swedish Academy of Sciences. (2020). The Nobel Prize in Chemistry 2020. [官方新闻稿](https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2020/press-release/)

本期赵森提及的诺奖背景:Emmanuelle Charpentier 与 Jennifer A. Doudna 因“发展了一种基因组编辑方法”共同获得 2020 年诺贝尔化学奖。Charpentier 团队发现 tracrRNA,并揭示其参与 crRNA 成熟的机制;随后双方团队合作,于 2012 年阐明双 RNA 引导的 Cas9 DNA 切割机制,并将 crRNA 与 tracrRNA 合并为单一嵌合引导 RNA,为可编程基因组编辑奠定生化基础。2013 年,张锋团队与 George Church 团队分别报道了哺乳动物细胞中的 CRISPR-Cas9 基因组编辑。

若对播客有任何问题或者投稿,或需要获得文字版音频总结,请联系我 [email protected]
小红书 / 微博:@撸森森
同时也可以添加微信 zhaosen830 进入听友交流群,谢谢 Thanks♪(・ω・)ノ


在小宇宙查看该单集文稿

说明里标出的时间点,点一下跳过去

AI 看点

本期看点

AI 从整集转写里归纳的,不是节目方的宣传语

最值得听的

用灭活狂犬病毒反向感染雪貂视觉皮层的反馈神经元,再用光刺激、超声测血流,把一条极弱的反馈通路单独拎出来研究。

别处听不到的

嘉宾亲历雪貂脑部病毒注射与长达三十小时的超声实验,并给出创业公司用AI检索ISO标准、预判FDA审查角度的具体做法。

最打动人的

精神分裂症患者看到的东西更接近想象而非现实,因为高级皮层向初级皮层的反馈信号比常人强得多。

AI 推荐理由

为什么值得听

AI 读完整集转写后给出的推荐理由

一位做超声脑成像的博士,讲他怎么把光遗传学和功能性超声接在一起:用灭活狂犬病毒反向感染雪貂视觉皮层的反馈神经元,再用光刺激、用超声测血流,单次实验要跑二十四到三十小时。他还解释了为什么精神分裂症患者看到的更接近想象,以及波士顿的医疗设备创业公司怎么用AI查ISO标准、过FDA审批。

AI 概要

本期概要

由 AI 从整集转写生成,是创作者说明之外的补充

2026年诺贝尔生理学或医学奖授予光遗传学三位奠基者。主播赵森请来波士顿的胡文韬博士,从这项诺奖讲起:光遗传学如何用来自绿藻的感光蛋白精准操控神经元,为神经科学提供控制变量的研究工具;胡文韬如何用功能性超声结合光遗传学,在雪貂身上研究视觉系统的反馈通路,以及狂犬病毒反向感染、二十四到三十小时的实验等一手细节。节目后半段延伸到 CRISPR 与 Hubel-Wiesel 两次诺奖的科学史对比、ReLU 与卷积神经网络对大脑机制的借鉴、大模型与人脑在信息效率与能耗上的差距,最后聊到从学术界转向工业界的判断标准,以及 AI 在医疗设备创业公司中的实际用法和给博士生的建议。

AI 识别的章节

章节

点一章从那里开始播 · 与上面创作者标的时间点各自独立

00:03

三年后的一次远程重逢

主播赵森介绍嘉宾胡文韬,两人2023年圣诞在休斯顿共进晚餐的渊源。胡文韬简述自己2018年起做医学图像与超声图像处理,因合作者而接触视觉神经科学与光遗传学。

01:57

光遗传学:从绿藻到神经元的控制开关

主播系统介绍2026年诺奖:Hegemann与Nagel在绿藻中发现Channelrhodopsin,Deisseroth团队2005年将其导入哺乳动物神经元。嘉宾补充其价值在于精准指定哪类细胞被激活,提供控制变量的研究方法。

05:22

超声测血流,追问视觉的反馈通路

胡文韬讲述博士初期项目不顺,转向功能性超声,2020年搭出测脑血流的系统。合作者研究高级皮层向初级皮层的反馈,精神分裂症患者该反馈异常增强,为研究弱信号埋下伏笔。

13:53

用光遗传学放大那个微弱信号

要研究反馈信号需抑制真实输入、加强反馈。团队用光遗传学感染负责反馈的神经元,再光照刺激并用超声测血流变化,判断刺激强度与作用区域。

16:17

为什么选雪貂:便宜且双眼接近人

雪貂是食肉动物,有双眼重叠视野,视觉结构接近人,成本远低于猴子。实验用灭活狂犬病毒反向感染视觉皮层的反馈细胞,再用染色剂与组织切片重建链路。

19:10

脑部注射与三十小时实验

胡文韬分享亲手做动物实验的挑战:脑部注射精度要求高、容错小,起初只能观摩;超声测量阶段为多取数据,单次实验可持续二十四到三十小时,远超最初预期。

21:17

临床转化的天花板是伦理

功能性超声受头骨吸收限制,目前多用于手术中与头骨薄的新生儿,成本低于功能核磁。光遗传学或可用于视觉恢复,但把外源基因导入人基因组面临巨大伦理挑战。

24:05

CRISPR与光遗传学的同一种思路

主播分享印象最深的2020年CRISPR诺奖,回忆清华本科时课程与文献精读都在讲它,并提到张锋2013年首次在哺乳动物应用CRISPR,而他正是Deisseroth光遗传学论文的第二作者。

28:19

Hubel与Wiesel:十五年建立视觉研究范式

胡文韬选1981年诺奖,两人1960至1970年代用电信号测量在猫、雪貂、猴子上奠定现代视觉神经科学基础。他观察到诺奖从成果到获奖的周期正在缩短。

31:41

ReLU、卷积网络与大脑的借鉴关系

胡文韬解释ReLU对应神经元放电阈值,是从线性到非线性的转化;卷积神经网络借鉴近邻神经元处理相近信息的空间组织,逐层从局部抽象到全局;强化学习对应奖励机制。

36:52

大模型与人脑:信息量与能耗的错位

婴儿一两年获取的信息远少于训练大模型所用的互联网数据,效果却未必差。大模型能耗高、信号连续,人脑信号稀疏、脉冲式,稀疏机制或可为网络结构提供借鉴。

41:17

离开学术界的判断标准

胡文韬以行业中下游待遇判断行业好坏,认为终身轨筛选严酷,走通的人对研究有极大热情。他加入波士顿一家做可穿戴医疗设备的创业公司,看重接触面广与工程考量。

46:02

AI在医疗设备公司里干什么

明确需求直接交给Claude、Codex写代码,模糊需求仍靠人想清楚。AI还用于检查提交监管的文档、预判审查角度、检索ISO标准与过往专利,大幅加快检索与合规工作。

48:51

给博士生的建议:把AI当工具,练提问能力

胡文韬建议把AI当工具,博士训练给的严谨思考与验证方式无法被替代;当执行变容易,基于科研现状提出该问什么才是稀缺能力。最后提醒AI写的东西自己还要再看一遍。

医学遗传前沿 · 更多单集

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医学遗传前沿

医EP50 从光遗传学(optogenetics)聊起@胡文韬

医学遗传前沿 · 10 月 15 日 · 51 分钟

EP50 从光遗传学(optogenetics)聊起@胡文韬

在小宇宙播放
创作者写的节目说明

本期节目,和来自美国波士顿的胡文韬博士漫谈,从今年诺贝尔生理学或医学奖的获奖领域 optogenetics(光遗传学)聊起,深入了解一下文韬在美国罗切斯特大学的 PhD 研究工作;各自分享一个自己印象比较深刻的诺奖;而后探讨神经科学对于人工智能及大语言模型发展的指导和提示意义;最终聊一聊从学界转向工业界的心路历程和北美求职的一些经验~

时间线

光遗传学简介与文韬的 PhD 工作内容

脑部超声和光遗传研究工作的临床转化展望

各自分享印象比较深刻的一个诺奖

生物的神经网络对 AI 神经网络的启发

从学界到工业界的心路历程及北美求职经验

参考文献

## 参考文献与延伸阅读

### 文韬的博士研究

1. Hu W, Zhu S, Briggs F, Doyley MM. (2023). Functional ultrasound imaging reveals 3D structure of orientation domains in ferret primary visual cortex. NeuroImage, 268, 119889. [论文链接](https://doi.org/10.1016/j.neuroimage.2023.119889)|[开放全文](https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9999292/)

文韬第一作者的正式期刊论文:利用功能超声成像研究雪貂初级视觉皮层方向选择性功能区的三维结构。该文不报告光遗传学实验。

2. Hu W. (2024). Functional ultrasound imaging of the ferret early visual system. 博士学位论文,University of Rochester,Department of Electrical and Computer Engineering. [论文及全文下载](https://hdl.handle.net/1802/38273)

包括视觉功能组织、视网膜拓扑,以及结合光遗传学研究皮层膝状体反馈的工作。

3. Hu W, Zhu S, Briggs F, Doyley M. (2023). Functional Ultrasound Imaging Reveals Optogenetic Activation of Neuronal Clusters in Ferret Primary Visual Cortex. 2023 IEEE International Ultrasonics Symposium (IUS),会议海报报告,编号 B2P-15-MIM-1. [官方会议日程](https://confcats-siteplex.s3.us-east-1.amazonaws.com/ius23/IUS_2023_Program_V2_9095ef329c.pdf)

功能超声检测光遗传刺激相关神经元群活动的会议报告;此处按会议日程记录引用,不作为已确认的期刊论文。

### 光遗传学的关键发现与细胞靶向方法

4. Nagel G, et al. (2002). Channelrhodopsin-1: A light-gated proton channel in green algae. Science, 296(5577), 2395–2398. [论文链接](https://doi.org/10.1126/science.1072068)

鉴定绿藻通道视紫红质 ChR1,揭示其光门控质子通道功能。

5. Nagel G, et al. (2003). Channelrhodopsin-2, a directly light-gated cation-selective membrane channel. Proceedings of the National Academy of Sciences, 100(24), 13940–13945. [论文链接](https://doi.org/10.1073/pnas.1936192100)|[开放全文](https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC283525/)

阐明 ChR2 的直接光门控阳离子通道功能,为后续神经活动调控提供分子基础。

6. Boyden ES, Zhang F, Bamberg E, Nagel G, Deisseroth K. (2005). Millisecond-timescale, genetically targeted optical control of neural activity. Nature Neuroscience, 8, 1263–1268. [论文链接](https://doi.org/10.1038/nn1525)

在培养的哺乳动物神经元中,利用 ChR2 实现毫秒尺度的光学活动控制;张锋是该文第二作者。

7. Zhang F, et al. (2007). Multimodal fast optical interrogation of neural circuitry. Nature, 446, 633–639. [论文链接](https://doi.org/10.1038/nature05744)

结合光激活与光抑制工具,实现神经活动的双向调控;张锋为第一作者。

### 诺奖背景资料

- Karolinska Institutet. (2026). The Nobel Prize to the pioneers of optogenetics Peter Hegemann, Georg Nagel and Karl Deisseroth. [获奖介绍与研究背景](https://news.ki.se/the-nobel-prize-to-the-pioneers-of-optogenetics-peter-hegemann-georg-nagel-and-karl-deisseroth) 光遗传

- NobelPrize.org. (1981). The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1981. [官方获奖介绍](https://www.nobelprize.org/prizes/medicine/1981/summary/)

本期文韬提及的诺奖背景:David H. Hubel 与 Torsten N. Wiesel 因关于视觉系统信息加工的发现共同获得一半奖金;Roger W. Sperry 因关于大脑半球功能特化的发现获得另一半奖金。Hubel 与 Wiesel 对视觉皮层神经元特征选择性及功能组织的研究,与本期讨论的方向选择性和视觉皮层组织直接相关。[Hubel 诺奖演讲](https://www.nobelprize.org/uploads/2018/06/hubel-lecture.pdf)|[Wiesel 诺奖演讲](https://www.nobelprize.org/uploads/2018/06/wiesel-lecture.pdf)

- The Royal Swedish Academy of Sciences. (2020). The Nobel Prize in Chemistry 2020. [官方新闻稿](https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2020/press-release/)

本期赵森提及的诺奖背景:Emmanuelle Charpentier 与 Jennifer A. Doudna 因“发展了一种基因组编辑方法”共同获得 2020 年诺贝尔化学奖。Charpentier 团队发现 tracrRNA,并揭示其参与 crRNA 成熟的机制;随后双方团队合作,于 2012 年阐明双 RNA 引导的 Cas9 DNA 切割机制,并将 crRNA 与 tracrRNA 合并为单一嵌合引导 RNA,为可编程基因组编辑奠定生化基础。2013 年,张锋团队与 George Church 团队分别报道了哺乳动物细胞中的 CRISPR-Cas9 基因组编辑。

若对播客有任何问题或者投稿,或需要获得文字版音频总结,请联系我 [email protected]
小红书 / 微博:@撸森森
同时也可以添加微信 zhaosen830 进入听友交流群,谢谢 Thanks♪(・ω・)ノ


在小宇宙查看该单集文稿

说明里标出的时间点,点一下跳过去

AI 看点

本期看点

AI 从整集转写里归纳的,不是节目方的宣传语

最值得听的

用灭活狂犬病毒反向感染雪貂视觉皮层的反馈神经元,再用光刺激、超声测血流,把一条极弱的反馈通路单独拎出来研究。

别处听不到的

嘉宾亲历雪貂脑部病毒注射与长达三十小时的超声实验,并给出创业公司用AI检索ISO标准、预判FDA审查角度的具体做法。

最打动人的

精神分裂症患者看到的东西更接近想象而非现实,因为高级皮层向初级皮层的反馈信号比常人强得多。

AI 推荐理由

为什么值得听

AI 读完整集转写后给出的推荐理由

一位做超声脑成像的博士,讲他怎么把光遗传学和功能性超声接在一起:用灭活狂犬病毒反向感染雪貂视觉皮层的反馈神经元,再用光刺激、用超声测血流,单次实验要跑二十四到三十小时。他还解释了为什么精神分裂症患者看到的更接近想象,以及波士顿的医疗设备创业公司怎么用AI查ISO标准、过FDA审批。

AI 概要

本期概要

由 AI 从整集转写生成,是创作者说明之外的补充

2026年诺贝尔生理学或医学奖授予光遗传学三位奠基者。主播赵森请来波士顿的胡文韬博士,从这项诺奖讲起:光遗传学如何用来自绿藻的感光蛋白精准操控神经元,为神经科学提供控制变量的研究工具;胡文韬如何用功能性超声结合光遗传学,在雪貂身上研究视觉系统的反馈通路,以及狂犬病毒反向感染、二十四到三十小时的实验等一手细节。节目后半段延伸到 CRISPR 与 Hubel-Wiesel 两次诺奖的科学史对比、ReLU 与卷积神经网络对大脑机制的借鉴、大模型与人脑在信息效率与能耗上的差距,最后聊到从学术界转向工业界的判断标准,以及 AI 在医疗设备创业公司中的实际用法和给博士生的建议。

AI 识别的章节

章节

点一章从那里开始播 · 与创作者标的时间点各自独立

00:03

三年后的一次远程重逢

01:57

光遗传学:从绿藻到神经元的控制开关

05:22

超声测血流,追问视觉的反馈通路

13:53

用光遗传学放大那个微弱信号

16:17

为什么选雪貂:便宜且双眼接近人

19:10

脑部注射与三十小时实验

21:17

临床转化的天花板是伦理

24:05

CRISPR与光遗传学的同一种思路

28:19

Hubel与Wiesel:十五年建立视觉研究范式

31:41

ReLU、卷积网络与大脑的借鉴关系

36:52

大模型与人脑:信息量与能耗的错位

41:17

离开学术界的判断标准

46:02

AI在医疗设备公司里干什么

48:51

给博士生的建议:把AI当工具,练提问能力

本期提到的品牌与产品

节目里自然聊到的,不是广告

罗切斯特大学嘉宾博士就读方向相关背景
01:04中性
Channelrhodopsin绿藻中发现的感光离子通道蛋白
03:03中性
Claude嘉宾公司用于写代码的AI工具
46:28正面
Codex嘉宾公司用于写代码的AI工具
46:28正面
FDA医疗设备需通过的监管审批
44:52中性
医医学遗传前沿

医学遗传前沿

面向医学遗传与生命科学前沿的科研方法学播客,兼顾技术拆解、监管伦理与学术职业生态

已收录 50 期 · 最近更新 10 月 15 日

这一期适合谁

AI 对内容的推测

听众画像25–34 岁为主 · 偏男性 · 消费力中等
更适合生命科学与神经科学研究者

这一期偏哪一派

偏沪派主播事前准备诺奖背景与定义,按研究故事、诺奖、AI、职业四段推进,问题意识明确,嘉宾专业性驱动内容。

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